(1)MES系统主制与协作信息不畅引起的问题:例如对于军品生产，其生产管理大量采用主制车间负责的思路，从而导致其负责的生产零件在周转到外车间后无法控制的问题存在，因此，需要建立双方的有效沟通机制，如提前将需要外车间协作的生产任务告知对方，让对方能够提前准备。
     (2)MES系统计划组长与计划员的沟通不足问题：由于项目型管理的要求，不同的计划员负责不同的型号项目，各个计划员为了保证自身负责产品能够顺利完成，必然通过各种措施干扰预定的生产计划正常进行，会频繁出现争抢设备的现象，因此，要求计划组长与计划员能够建立有效的沟通机制，实现在统一设备资源能力的基础上进行有序的作业排产安排，提高制造执行的协调性，从而促进作业的有序进行，为高效运行提供支持。
     (3)MES系统技术问题的协调需要快速协商机制:在制造执行过程中，会出现各种各样的技术问题，如需要工艺人员、编程人员现场处理的问题，应该提供有效的保证机制，建立双方的快速协调，如通过作业执行看板对需要重点工艺关注的生产环节建立现场生产与相关人员的协调。
    (4)MES系统计划任务一作业调度一执行反馈脱节的问题:计划任务的变更或者调整能否快速反映到对作业计划进行实时更新，作业调度能否及时获得执行反馈信息，都是影响制造执行有序运行的关键问题，建立模块化的体系结构，形成各模块之间良好的互动协调机制，是解决这一问题的关键。

    (1)MES系统数据集成与协调不一致性的问题:数据的集成与协调是制造执行过程必须面对的问题，为了保证双方的数据能够保持一致，必须尽可能地采取统一数据源的方法，或采用通用的中间数据格式。
    (2)MES系统急件任务频繁插人的问题:制造执行过程中，任务是影响系统顺畅运行且必须解决的核心和源头问题，为了避免频繁的急件任务插人现象的发生，需要在生产任务动态管理中，进行综合的协调，尽量为作业顺畅执行提供充足的时间，降低对有序生产的冲击，如采取提前发放任务、任务均衡发放等方法，实现生产任务的综合协调处理。
    (3)MES系统生产准备不足的问题:建立生产准备管理功能模块，并与制造执行看板进行关联，根据作业执行情况，合理规划生产准备任务，为生产准备任务规划合理的提前期，保证生产准备能够满足生产作业的要求。
 

     无论多么完善的技术措施都无法全面涵盖制造执行中出现的全部生产扰动，MES系统生产中还是可能出现多种多样的扰动，从而干扰作业计划的正常执行，对于这些扰动事件应采取问题的隔离措施，尽量减少受影响范围。
    (1)MES系统实际执行与作业计划不符、生产任务插人的问题:建立受影响工序集合和偏差容忍度概念，在保证作业计划与生产实际基本一致的前提下，尽量减小由于扰动事件对作业计划造成的影响。
    (2)MES系统生产计划插人、追加和工序更改的问题:建立设备空闲时间遍历方法，将添加的生产工序在满足交货期的前提下，尽量安排在设备上的空闲时间进行加工。
 

     MES系统扰动事件中的一些虽然可以通过问题隔离有效地减小影响范围，但是依然会对今后的生产任务造成影响。因此必须建立一套快速响应机制对生产扰动进行快速的、有效的处理。在生产过程中将这些影响到生产而必须快速响应的生产扰动称为扰动事件。根据对扰动事件的处理策略可以分为：
     (1)MES系统自动响应的扰动事件:计划安排的工序作业时间由于种种原因导致开工时间、完工时间与计划时间不一致，造成作业计划无法与生产现场保持同步，通过短时间的积累，即可使得作业计划无法再对生产现场具有指导意义或者指导偏差加大，采用自动响应策略按照生产设备及顺序不发生变化的原则对生产执行中的这一情况进行响应。
     (2)MES系统人机交互响应的扰动事件:虽然自动调度算法能够快速地生成作业排产计划，但很难考虑工序执行时不同人员技能、设备状态的差异等，这些都会严重影响作业计划的可执行性，因此，有必要建立人机交互的调度机制，能够为调度人员提供充分发挥其经验的功能。
     (3)MES系统采用重调度方法响应的扰动事件:采取动态调度的机制，对任务插人、分批、设备故障等问题，利用重调度算法，进行快速的作业计划的调整，实现对该类问题的快速响应。